我用visio新建了個跨職能流程圖的文件，試了試，沒有遇見你說的問題。文件保存后，再打開，就是上次保存的文件的樣子，沒有彈出來，那就幫不了你了。是不是軟件的問題或安裝的問題……？呵呵，祝你好運。
不過這是個小問題，你這個圖應該也用不了多長時間，即使它每次讓你點擊，但也不至于讓你心煩，不值得。過段時間不用它了就不用看見它了，O(∩_∩)O~開心點！

沒有碰到過這個問題，可以找下文件中是否插入了職能流程圖的圖元，然后刪除掉試試！

用visio2010.。。。

在Visio中建立跨職能流程圖時，不要選中“包括標題欄”

應該是注冊表的問題！
我把07的注冊表全刪了。現在裝了個10的Visio，當然我的常用辦公軟件也是10的。。
（按我的方法的話，必須把07的辦公軟件全卸載了。想裝10的話，給我郵箱，我也有破解器）
下面的方法可能有點煩，但是很有用。。。如果不嫌麻煩，可以試試

重要說明 - 刪除 Office 2007 之前需要了解的信息：
在“工具”菜單上，單擊“文件夾選項”。在 Windows 7 或 Vista 中，按 ALT 鍵顯示菜單欄。單擊“查看”選項卡。在“高級設置”窗格中，單擊“隱藏文件和文件夾”下的“顯示隱藏文件和文件夾”。清除“隱藏已知文件類型的擴展名”復選框。單擊“確定”，然后關閉窗口。

步驟 1：刪除所有剩余的 2007 Microsoft Office 系統的 Windows 安裝程序包。
1、單擊“運行”，然后在“打開”框中單擊。鍵入 installer，然后單擊“確定”。
2、在“查看”菜單上，單擊“選擇詳細信息”。單擊以選中“主題”復選框，在“所選列的寬度(像素)”框中鍵入 340，然后單擊“確定”。
注意 可能幾分鐘后主題才能顯示在每個 .MSI 文件旁。
3、在“視圖”菜單上，指向 Windows 7 或 Vista 中的“排序”，
如果出現“用戶帳戶控制”對話框，請單擊“允許”繼續。
4、找到每個主題為“Microsoft Office <產品名稱> 2007”的 .MSI 文件，右鍵單擊 .MSI file，然后單擊“卸載”。

步驟 2：停止 Office Source Engine 服務。
1、單擊“運行”，然后在“打開”框中單擊。
2、鍵入 services.msc，然后單擊“確定”。
3、在“服務”窗口，確定“Office Source Engine”服務是否正在運行（“已啟動”將顯示在“狀態”列）。如果此服務正在運行，右鍵單擊“Office Source Engine”，然后單擊“停止”。
關閉“服務”窗口。

步驟 3：刪除所有剩余的 2007 Microsoft Office 安裝文件夾。
1、單擊“運行”，然后在“打開”框中單擊。
2、鍵入 %CommonProgramFiles%\Microsoft Shared，然后單擊“確定”。注意 在運行 64 位版本的 Windows 7 或 Vista 的計算機上，鍵入 %CommonProgramFiles(x86)%\Microsoft Shared，然后單擊“確定”。
3、如果出現以下文件夾，請將其刪除：Office12Source Engine
4、單擊“運行”，然后在“打開”框中單擊。
鍵入 %ProgramFiles%\Microsoft Office，然后單擊“確定”。
注意 在運行 64 位版本的 Windows 7 或 Vista 的計算機上，鍵入 %ProgramFiles(x86)%\Microsoft Office，然后單擊“確定”。
刪除 Office12 文件夾。
5、在每個硬盤驅動器的根文件夾上，找到并打開“MSOCache”文件夾。如果看不到此文件夾，請執行以下步驟：
a.打開 Windows Explorer，然后在“工具”菜單上，單擊“文件夾選項”。
b.單擊“視圖”選項卡。
c.在“高級設置”窗格中，單擊“隱藏文件和文件夾”下的“顯示隱藏文件和文件夾”。
d.清除“隱藏受保護的操作系統文件”復選框，然后單擊“確定”。
6、打開“MSOCache”文件夾中的“所有用戶”文件夾，然后刪除所有文件夾名稱中包含 0FF1CE}- 文本的文件夾。
注意 此文本中包含一個“零”和一個“一”，對應字母“O”和“I”。
示例 {90140000-001B-0409-0000-0000000FF1CE}-C

步驟 4：刪除所有剩余的 2007 Microsoft Office 安裝文件。
1、單擊“運行”，然后在“打開”框中單擊。鍵入 %appdata%\microsoft\templates，然后單擊“確定”。刪除以下文件：Normal.dotmNormalemail.dotm
單擊“運行”，然后在“打開”框中單擊。
2、鍵入 %appdata%\microsoft\document building blocks，然后單擊“確定”。
打開在“文檔構建基塊”文件夾中找到的子文件夾。
注意 子文件夾標題是一個四位數字，此數字代表 Microsoft Office 套件的語言。
3、刪除“building blocks.dotx”文件。
執行剩余步驟之前請關閉所有程序。
4、單擊“運行”，然后在“打開”框中單擊。鍵入“%temp%”，然后單擊“確定”。在“編輯”菜單上，單擊“全選”。在“文件”菜單上菜單上，單擊“刪除”。
5、單擊“運行”，然后在“打開”框中單擊。鍵入 %AllUsersprofile%\Application Data\Microsoft\Office\Data，然后單擊“確定”。
刪除“opa12.dat”文件（僅刪除此文件）。

步驟 5：刪除 2007 Microsoft Office 系統的注冊表子項。
1、單擊“運行”，然后在“打開”框中單擊。鍵入 regedit，然后單擊“確定”。
2、刪除以下注冊表子項：

注意：在以下注冊表項中，星號字符 (*) 代表子項名稱中的一個或多個字符。
32 位版本的 Microsoft Windows
HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Office\12.0
HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Office\12.0
HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Office\Delivery\SourceEngine\Downloads\*0FF1CE}-*
HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Uninstall\*0FF1CE*
HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Installer\Upgrade Codes\*F01FEC
HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Installer\UserData\S-1-5-18\Products\*F01FEC
HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Services\ose
HKEY_CLASSES_ROOT\Installer\Features\*F01FEC
HKEY_CLASSES_ROOT\Installer\Products\*F01FEC
HKEY_CLASSES_ROOT\Installer\UpgradeCodes\*F01FEC
HKEY_CLASSES_ROOT\Installer\Win32Assemblies\*Office12*
64 位版本的 Microsoft Windows

HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Office\12.0
HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Wow6432Node\Microsoft\Office\12.0
HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Wow6432Node\Microsoft\Office\Delivery\SourceEngine\Downloads\*0FF1CE}-*
HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Wow6432Node\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Uninstall\*0FF1CE*
HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Wow6432Node\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Installer\UpgradeCodes\*F01FEC
HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Wow6432Node\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Installer\UserData\S-1-5-18\Products\*F01FEC
HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Services\ose
HKEY_CLASSES_ROOT\Installer\Features\*F01FEC
HKEY_CLASSES_ROOT\Installer\Products\*F01FEC
HKEY_CLASSES_ROOT\Installer\UpgradeCodes\*F01FEC
HKEY_CLASSES_ROOT\Installer\Win32Asemblies\*Office12*

步驟 6：重新啟動該計算機。

我也在網上找了好久的辦法。今天竟然解決了！

很簡單：要想先卸載，就要先修復。

在控制面板-卸載程序-單擊Visio2007郵件選擇【更改】（而不是卸載）-選擇【修復】-待完成后，再單擊右鍵visio 2007選擇【卸載】，卸載完成。

你說的應該是Microsoft Office VIsio吧，這是一款畫流程圖的軟件。安裝之前要保證系統已經安裝了net.Framwork還有個PS2補丁。實際上就是環境組件。只有安裝了這個才能安裝Visio（還有VS2005VS2008環境組件這個也得安裝）
我安裝的是Microsoft Office Visio 2007安裝時有提示的。你下載的時候注意一下應該也有說明

找個例子出來看一下：放入內容，然后保存，然后再看一下你的結果是什么樣子的。