專利管理機(jī)關(guān)可以處理下列糾紛:1、專利侵權(quán)糾紛;2、有關(guān)發(fā)明專利申請(qǐng)公布后，專利權(quán)授予前，他人實(shí)施發(fā)明的費(fèi)用糾紛;3、專利申請(qǐng)權(quán)和專利權(quán)歸屬糾紛;4、關(guān)于對(duì)職務(wù)發(fā)明人獎(jiǎng)勵(lì)和報(bào)酬的糾紛。 《中華人民共和國專利法》 第六十條 未經(jīng)專利權(quán)人許可，實(shí)施其專利，即侵犯其專利權(quán)，引起糾紛的，由當(dāng)事人協(xié)商解決;不愿協(xié)商或者協(xié)商不成的，專利權(quán)人或者利害關(guān)系人可以向人民法院起訴，也可以請(qǐng)求管理專利工作的部門處理。管理專利工作的部門處理時(shí)，認(rèn)定侵權(quán)行為成立的，可以責(zé)令侵權(quán)人立即停止侵權(quán)行為，當(dāng)事人不服的，可以自收到處理通知之日起十五日內(nèi)依照《中華人民共和國行政訴訟法》向人民法院起訴;侵權(quán)人期滿不起訴又不停止侵權(quán)行為的，管理專利工作的部門可以申請(qǐng)人民法院強(qiáng)制執(zhí)行。進(jìn)行處理的管理專利工作的部門應(yīng)當(dāng)事人的請(qǐng)求，可以就侵犯專利權(quán)的賠償數(shù)額進(jìn)行調(diào)解;調(diào)解不成的，當(dāng)事人可以依照《中華人民共和國民事訴訟法》向人民法院起訴。

專利糾紛有：
1、專利合同糾紛。例如，許可實(shí)施合同糾紛、專利轉(zhuǎn)讓合同糾紛、報(bào)酬糾紛；
2、專利權(quán)權(quán)屬糾紛。例如，署名權(quán)糾紛、申請(qǐng)專利權(quán)糾紛、獨(dú)占實(shí)施權(quán)糾紛；
3、專利權(quán)侵權(quán)糾紛；
4、其他糾紛種類。
【法律依據(jù)】
《民事案件案由規(guī)定》
148.專利合同糾紛
60.專利權(quán)權(quán)屬、侵權(quán)糾紛
（1）專利申請(qǐng)權(quán)權(quán)屬糾紛
（2）專利權(quán)權(quán)屬糾紛
（3）侵害發(fā)明專利權(quán)糾紛
（4）侵害實(shí)用新型專利權(quán)糾紛
（5）侵害外觀設(shè)計(jì)專利權(quán)糾紛
（6）假冒他人專利糾紛
（7）發(fā)明專利臨時(shí)保護(hù)期使用費(fèi)糾紛
（8）職務(wù)發(fā)明創(chuàng)造發(fā)明人、設(shè)計(jì)人獎(jiǎng)勵(lì)、報(bào)酬糾紛
（9）發(fā)明創(chuàng)造發(fā)明人、設(shè)計(jì)人署名權(quán)糾紛
（10）標(biāo)準(zhǔn)必要專利使用費(fèi)糾紛

摘要：在這個(gè)注重創(chuàng)新，崇尚創(chuàng)新的時(shí)代，國家和社會(huì)對(duì)于創(chuàng)造性活動(dòng)非常重視，并給予這些活動(dòng)成果認(rèn)證，這里的知識(shí)產(chǎn)權(quán)就是其中一種。知識(shí)產(chǎn)權(quán)是人對(duì)其所創(chuàng)作的智力勞動(dòng)成果所享有的專有權(quán)利。發(fā)明、文學(xué)和藝術(shù)作品，以及在商業(yè)中使用的標(biāo)志、名稱、圖像以及外觀設(shè)計(jì)，都可被認(rèn)為是某一個(gè)人或組織所擁有的知識(shí)產(chǎn)權(quán)。那么，常見的知識(shí)產(chǎn)權(quán)糾紛有哪些？知識(shí)產(chǎn)權(quán)糾紛訴訟流程是怎樣的？以下就和小編一起來了解一下吧。常見的知識(shí)產(chǎn)權(quán)糾紛有哪些
知識(shí)產(chǎn)權(quán)糾紛類型主要有歸屬權(quán)糾紛、侵權(quán)糾紛、合同糾紛和行政糾紛。
1、歸屬權(quán)糾紛。是指主體之間誰是真正的知識(shí)產(chǎn)權(quán)人，誰應(yīng)該具有知識(shí)產(chǎn)權(quán)所發(fā)生的爭(zhēng)議，如是單方知識(shí)產(chǎn)權(quán)人還是共同知識(shí)產(chǎn)權(quán)人等糾紛。
2、侵權(quán)糾紛。是指知識(shí)產(chǎn)權(quán)人與不特定第三人因侵權(quán)行為發(fā)生的爭(zhēng)議，如未經(jīng)知識(shí)產(chǎn)權(quán)人許可，擅自使用其知識(shí)產(chǎn)權(quán)導(dǎo)致雙方發(fā)生的糾紛。
3、合同糾紛。是指知識(shí)產(chǎn)權(quán)轉(zhuǎn)讓、許可使用等合伺中各方當(dāng)事人因合同而引起的爭(zhēng)議，如受讓方超越合同授權(quán)導(dǎo)致雙方發(fā)生的糾紛。
4、行政糾紛。是指當(dāng)事人對(duì)知識(shí)產(chǎn)權(quán)行政管理機(jī)關(guān)所做出的決定不服而引起的爭(zhēng)議，如對(duì)有關(guān)行政機(jī)關(guān)的處理決定不服而產(chǎn)生的糾紛。
知識(shí)產(chǎn)權(quán)糾紛處理方法
1、協(xié)商。是指雙方當(dāng)事人在知識(shí)產(chǎn)權(quán)糾紛發(fā)生后，在自愿互諒的基礎(chǔ)上，按照有關(guān)法律的規(guī)定，通過直接的協(xié)商和談判，自行達(dá)成和解協(xié)議，從而使糾紛得到解決的活動(dòng)。
2、調(diào)解。是指知識(shí)產(chǎn)權(quán)糾紛發(fā)生后，經(jīng)雙方當(dāng)事人申請(qǐng)，由人民法院、仲裁機(jī)構(gòu)或調(diào)解人從中協(xié)調(diào)，使雙方當(dāng)事人在自愿協(xié)商的基礎(chǔ)上，互作讓步，達(dá)成協(xié)議，從而使糾紛得到解決的活動(dòng)。
3、行政處理。是指知識(shí)產(chǎn)權(quán)糾紛有關(guān)的當(dāng)事人或者不特定第三人請(qǐng)求知識(shí)產(chǎn)權(quán)行政管理機(jī)關(guān)處理其知識(shí)產(chǎn)權(quán)糾紛或與知識(shí)產(chǎn)權(quán)有關(guān)的侵權(quán)等違法行為的活動(dòng)。
4、仲裁。是指知識(shí)產(chǎn)權(quán)糾紛雙方當(dāng)事人在自愿基礎(chǔ)上達(dá)成協(xié)議，將糾紛提交仲裁機(jī)構(gòu)審理，由仲裁機(jī)構(gòu)做出對(duì)爭(zhēng)議雙方均有約束力的裁決的解決糾紛的制度。當(dāng)事人可以根據(jù)仲裁裁決或調(diào)解書要求對(duì)方承擔(dān)責(zé)任或履行義務(wù)，也可請(qǐng)求人民法院強(qiáng)制執(zhí)行。
5、民事訴訟。是指人民法院在知識(shí)產(chǎn)權(quán)糾紛雙方當(dāng)事人的參與下審理和解決知識(shí)產(chǎn)權(quán)糾紛案件的訴訟活動(dòng)。當(dāng)事人可以請(qǐng)求人民法院做出要求對(duì)方承擔(dān)責(zé)任或履行義務(wù)的判決書或調(diào)解書，并可請(qǐng)求人民法院強(qiáng)制執(zhí)行。
知識(shí)產(chǎn)權(quán)糾紛訴訟流程
一、權(quán)利證據(jù)
1、要舉證原告的主體資格，即自然人身份證或企業(yè)、事業(yè)單位的營業(yè)執(zhí)照及組織機(jī)構(gòu)代碼。
2、專利權(quán)證書，證明專利權(quán)授權(quán)時(shí)的權(quán)屬情況。
3、專利登記薄副本，證明專利權(quán)有過轉(zhuǎn)讓、有無被宣告無效等情況。
4、專利授權(quán)公告文本：發(fā)明或?qū)嵱眯滦偷臋?quán)利要求書，說明書，摘要及附圖，外觀設(shè)計(jì)的圖片及簡要說明。
5、專利年費(fèi)的收據(jù)，證明該專利持續(xù)有效情況。
6、專利管理部門的實(shí)用新型檢索報(bào)告。
二、侵權(quán)證據(jù)
1、書證：通常是公證書，發(fā)現(xiàn)侵權(quán)行為后，要及時(shí)與公證機(jī)關(guān)申請(qǐng)，對(duì)侵權(quán)產(chǎn)品、現(xiàn)場(chǎng)進(jìn)行勘查公證。如是銷售者，還要索取產(chǎn)品的廣告宣傳冊(cè)、銷售人員的名片、發(fā)票或收據(jù)等。
2、物證：從市場(chǎng)上購得侵權(quán)產(chǎn)品時(shí)，應(yīng)由公證人員對(duì)此進(jìn)行封存、拍照。
三、損失證據(jù)
1、專利許可合同，以此許可費(fèi)來計(jì)算損失。
2、財(cái)務(wù)審計(jì)報(bào)告，以侵權(quán)前與侵權(quán)后的利益損失為參考損失情況。
3、被告的財(cái)務(wù)報(bào)告，以被告的利益主原告的損失參考。
如果作為被告，往往會(huì)從如下方面進(jìn)行抗辯：
1、權(quán)利瑕疵抗辯；
2、不侵權(quán)抗辯；
3、公知技術(shù)抗辯；
4、先用抗辯；
5、侵權(quán)獲得低于原告抗辯；
6、合法來源的抗辯。

專利糾紛有下列主要的類型：權(quán)屬糾紛（包括專利權(quán)權(quán)屬糾紛和專利申請(qǐng)權(quán)糾紛）；專利侵權(quán)糾紛（即未經(jīng)專利權(quán)人許可，為生產(chǎn)經(jīng)營目的制造、使用、許諾銷售、銷售、進(jìn)口專利產(chǎn)品等行為）；專利許可使用合同或?qū)＠D(zhuǎn)讓合同糾紛。
【法律依據(jù)】
《中華人民共和國專利法》第十一條
發(fā)明和實(shí)用新型專利權(quán)被授予后，除本法另有規(guī)定的以外，任何單位或者個(gè)人未經(jīng)專利權(quán)人許可，都不得實(shí)施其專利，即不得為生產(chǎn)經(jīng)營目的制造、使用、許諾銷售、銷售、進(jìn)口其專利產(chǎn)品，或者使用其專利方法以及使用、許諾銷售、銷售、進(jìn)口依照該專利方法直接獲得的產(chǎn)品。外觀設(shè)計(jì)專利權(quán)被授予后，任何單位或者個(gè)人未經(jīng)專利權(quán)人許可，都不得實(shí)施其專利，即不得為生產(chǎn)經(jīng)營目的制造、許諾銷售、銷售、進(jìn)口其外觀設(shè)計(jì)專利產(chǎn)品。
第十二條
任何單位或者個(gè)人實(shí)施他人專利的，應(yīng)當(dāng)與專利權(quán)人訂立實(shí)施許可合同，向?qū)＠麢?quán)人支付專利使用費(fèi)。被許可人無權(quán)允許合同規(guī)定以外的任何單位或者個(gè)人實(shí)施該專利。